医生常用的诊断方法是经验方法，当一个病证超出医生的经验方法之外，就可以称为疑难病证。实际上诊断疑难病证并没有专门的方法，它只是一些基本诊断方法的变化运用，因此掌握基本诊断方法是解决疑难病证的必经之道。基本诊断方法有‘标尺对比法’和‘概念集合法’两种：

‘标尺对比法’通常是通过试验和大样本归纳，建立一个诊断要素与病证相对应的特征值表，以后只要对病证做相同试验，将试验结果去比对特征值表，就得到关于病证的判断；这个‘表’通常称为‘标尺’。应该说‘标尺对比法’是西医推崇的方法，做‘标尺’需要以精密仪器和试验流程为后盾，并且‘标尺’数据需要时时更新。

‘概念集合法’是把相关的诊断要素集合起来去定义一个病证，每一个诊断要素只反映病证的一个面或一个特征。同一症状在在每个医生的认识和使用中，语义上都会有部分相同、部分不同；相同部分相当于概念的交集，不同部分相当于概念的补集。但是这并不影响对概念的具体使用，医生要使用的往往就是概念的交集部分。这个交集使得每一个词目(诊断要素)中的内涵少了、简单了、定性了、集中了，同时使用面广了。例如：头痛，可以发生于几百种病证中，总的有三种可能：①每一种病证的头痛，其表现、病机、病性可能是不同的，②同一种病证的头痛，在不同人身上的表现是不同的，有人病轻，可能会大呼小叫，有人病重，但耐受力很强；③同一个人生病头痛，在不同时段会有不同表现。医生在诊断病证时重要的是确定有没有头痛，这是定性；依据头痛的表现去判断病机病性，一定还需要借助其它症状。单个诊断要素对判定病证只有概率上的意义，多个症状判定病证其概率意义就可以叠加，从而得到高概率结论。